影片背景设定于1960年代冷战时期，年轻的查尔斯·泽维尔（詹姆斯·麦卡沃伊 饰）与埃里克·兰谢尔（迈克尔·法斯宾德 饰）因各自天赋而相识，迅速成为挚友。查尔斯拥有强大的心灵感应能力，而埃里克能操控金属磁场，两人联手招募了一批变种人青年，组建起最初的X战警团队。他们首要目标是阻止由塞巴斯蒂安·肖（凯文·贝肯 饰）领导的变种人邪恶组织，后者企图利用美苏古巴导弹危机引爆核战，以达成变种人统治世界的野心。在对抗过程中，查尔斯与埃里克逐渐产生根本性分歧：查尔斯坚信人类与变种人能够和平共处，主张克制与包容；而埃里克因童年纳粹集中营的创伤，认定人类终将背叛变种人，唯有以武力自保甚至先发制人。最终决战中，埃里克为复仇杀死肖，并试图摧毁人类舰队，查尔斯为阻止他而身负重伤，导致终身瘫痪。两人彻底决裂，昔日挚友分道扬镳，各自走上截然不同的道路。影片不仅展现了变种人世界的起源，更深刻探讨了理想与现实的冲突，以及友谊如何在巨大分歧前崩塌。